MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK4

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010469	AAT	2	6	12	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010469	TCAT	2	8	21	28	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010469	TAT	2	6	65	70	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010469	A	7	7	1475	1481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010469	CTC	2	6	2015	2020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_010469	TCC	2	6	2051	2056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_010469	TAA	2	6	2086	2091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010469	TTA	2	6	2150	2155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010469	A	7	7	2167	2173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010469	GATA	2	8	2253	2260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010469	T	6	6	2280	2285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010469	CCG	2	6	2392	2397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_010469	ATA	2	6	2415	2420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010469	CTCGC	2	10	2486	2495	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_010469	GAG	2	6	2580	2585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010469	TAA	2	6	3920	3925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010469	CAT	2	6	3955	3960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010469	AAT	2	6	3965	3970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010469	TGTTT	2	10	4023	4032	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010469	TAT	2	6	4060	4065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010469	TAT	2	6	4120	4125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010469	ATA	2	6	4140	4145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010469	A	7	7	4152	4158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010469	A	7	7	4174	4180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010469	A	7	7	4196	4202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010469	AAAT	2	8	4226	4233	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010469	CAA	2	6	4302	4307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010469	A	6	6	6053	6058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010469	AGA	2	6	6063	6068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010469	TCT	2	6	6116	6121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010469	T	6	6	6149	6154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010469	A	8	8	6455	6462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010469	AAT	2	6	6466	6471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010469	ATTT	2	8	6482	6489	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010469	A	6	6	6490	6495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010469	AGG	2	6	6564	6569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010469	AGG	2	6	6572	6577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010469	A	6	6	7048	7053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010469	ATAG	2	8	7227	7234	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010469	TAGA	2	8	7235	7242	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010469	TAATA	2	10	7321	7330	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010469	AGG	2	6	7331	7336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010469	T	7	7	9518	9524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010469	ACCA	2	8	10209	10216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010469	GCT	2	6	10220	10225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010469	ATC	2	6	10252	10257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010469	AATA	2	8	10282	10289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010469	TA	3	6	10351	10356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010469	TAG	2	6	10401	10406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010469	GTT	2	6	10416	10421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010469	T	7	7	10420	10426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010469	ATA	2	6	10437	10442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010469	CGAT	2	8	10480	10487	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010469	AAT	2	6	10495	10500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010469	CTC	2	6	10525	10530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_010469	ATT	2	6	10617	10622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010469	TGT	2	6	10649	10654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010469	ATG	2	6	12126	12131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010469	T	6	6	12142	12147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.